(一)皈依发菩提心：(合掌)
诸佛正法圣贤僧
直至菩提我皈依
愿我所修诸功德
为利众生愿成佛
(二)药师佛 赞
平等慈悲对待一切众
但闻名号即救恶趣苦
医治三毒疾病药师佛
至诚顶礼本尊琉璃光
(三)诵念药师佛咒
(建议108次)
die ya ta ong bei kan ze bei kan ze ma ha bei kan ze la za sa mu ga die so ha
喋雅他 嗡 贝堪则 贝堪则 玛哈贝堪则 喇杂萨目 嘎喋 梭哈
(四)回向
愿消三障诸烦恼，
愿得智慧真明了，
普愿罪障悉消除，
世世常行菩萨道(一遍)。
以此持咒功德，特别回向信士×××罪障消除，身体康泰，恶疾痊愈，恶运转好，事业顺利，家庭和睦，消灾免难，吉祥如意。(在一条回向文可以根据情况适当变动)。
以上就是我们药师佛心咒念诵仪轨了，只要我们修行的时候能够将自己的心态放正，用心的去感悟经文，不论是药师佛心咒还是药师经的作用我们都是能够感受到的，都能够让我们更好的去修行的。以上只是作者对文章的一些理解，如果有不正确的地方还望海涵。
